66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2284 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  923    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  65.67 
 
 		 475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  60.8 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.65 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  29.24 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  26.64 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  25.99 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.7 
 
 		 482 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  26.21 
 
 		 445 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  24.12 
 
 		 441 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  25.12 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  25.12 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  24.77 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.25 
 
 		 877 aa  90.5  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  25.55 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  25.47 
 
 		 614 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.23 
 
 		 438 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.22 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.81 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.2 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.58 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  28.14 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  26.29 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  30.46 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.54 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  26.2 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  42.65 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  25.65 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  23.82 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  28.92 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  24.11 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  36.99 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.47 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  24.34 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  35.37 
 
 		 110 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  51.16 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  23.45 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  29.29 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.73 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  40.26 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  32.26 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  35.29 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.99 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 372 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.29 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  35.42 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.3 
 
 		 947 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  28.06 
 
 		 894 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.31 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  48.72 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  31.96 
 
 		 878 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  43.59 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  33.73 
 
 		 892 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.91 
 
 		 353 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  21.86 
 
 		 453 aa  47  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.55 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  30.49 
 
 		 146 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.77 
 
 		 703 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.48 
 
 		 528 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  29.33 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  30.77 
 
 		 967 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  30 
 
 		 463 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  35.71 
 
 		 730 aa  43.9  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>