65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1833 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  925    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  36.49 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  28.87 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  26.65 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  26.54 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  26.29 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  26.46 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  25.48 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  25.48 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  25.18 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  27.05 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.89 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.21 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  26.03 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.61 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.84 
 
 		 477 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.44 
 
 		 877 aa  96.7  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  23.96 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.25 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  24.67 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  22.15 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.52 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  25.51 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  27.59 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.27 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.29 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.35 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  21.93 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.37 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  24.11 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  24.12 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.49 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  23.24 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.18 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.72 
 
 		 947 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  25.83 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  29.76 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.73 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  31.91 
 
 		 110 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  29.73 
 
 		 530 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.35 
 
 		 483 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.54 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.48 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.72 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.64 
 
 		 293 aa  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  23.17 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.93 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  21.95 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  27.19 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.86 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.55 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  22.8 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.35 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  25.19 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  20.56 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  23.11 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.4 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  60 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  35.71 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.51 
 
 		 239 aa  43.1  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  30.88 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>