56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4397 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  971    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  65.67 
 
 		 450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  60 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  29.37 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  25.18 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.88 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  25.81 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  29.39 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  26.4 
 
 		 408 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  23.48 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25.12 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  23.48 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  31.72 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.47 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  22.48 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.81 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.67 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.02 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  26.19 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  30.85 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  23.72 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  24.34 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  28.73 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  24.45 
 
 		 313 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  24.48 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  25.48 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.67 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  20.09 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  19.85 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  25.18 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  28.11 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  21.89 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  24.83 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.4 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  33.78 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  52  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  33.68 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  23.61 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  36.47 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.16 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.52 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  34.21 
 
 		 535 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.37 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  19.28 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  30.09 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  45.24 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  39.02 
 
 		 878 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  33.82 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.49 
 
 		 947 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  44.44 
 
 		 703 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  30.59 
 
 		 146 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 		 315 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.29 
 
 		 375 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  36.62 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>