40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1681 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  100 
 
 		 366 aa  755    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.39 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.5 
 
 		 877 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.52 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  26.64 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  24.09 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  23.42 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  20.61 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.09 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.19 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  34.57 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  24.53 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  25.3 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.98 
 
 		 947 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  30.08 
 
 		 146 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.86 
 
 		 633 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.57 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.02 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  34.21 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  19.92 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  21.34 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  37.68 
 
 		 894 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.63 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  33.85 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.94 
 
 		 495 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  27.38 
 
 		 463 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  20.56 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  30.53 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 892 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.14 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  21.84 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  39.29 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.44 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  20.59 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  34.43 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  42.42 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  42.5 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  25.52 
 
 		 432 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>