85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2761 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  61.37 
 
 		 894 aa  1126    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 892 aa  1847    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  37.69 
 
 		 878 aa  554  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  34.64 
 
 		 916 aa  522  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  28 
 
 		 746 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  29.84 
 
 		 731 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  29.14 
 
 		 751 aa  267  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.05 
 
 		 737 aa  247  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.58 
 
 		 703 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  27.72 
 
 		 747 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.52 
 
 		 651 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1045 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1070 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1071 aa  207  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1118 aa  196  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.47 
 
 		 936 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  23.48 
 
 		 934 aa  174  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1001 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  22.51 
 
 		 961 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.56 
 
 		 967 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  22.64 
 
 		 937 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  22.24 
 
 		 982 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1003 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.09 
 
 		 792 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  24.35 
 
 		 920 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  22.8 
 
 		 996 aa  129  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  22.33 
 
 		 968 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  22.62 
 
 		 906 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  21.92 
 
 		 933 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1008 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1279 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  20.64 
 
 		 848 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  20.73 
 
 		 969 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1106 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  29.48 
 
 		 256 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  24.76 
 
 		 972 aa  97.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  22.46 
 
 		 610 aa  93.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  22.49 
 
 		 561 aa  89.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  23.17 
 
 		 947 aa  88.6  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  20.74 
 
 		 968 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  24.33 
 
 		 951 aa  84  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  20.18 
 
 		 1001 aa  83.2  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  24.26 
 
 		 960 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.88 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  25.32 
 
 		 962 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.12 
 
 		 965 aa  80.5  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  25.4 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  24.72 
 
 		 969 aa  79  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.32 
 
 		 995 aa  77.8  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1012 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  27.45 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.07 
 
 		 911 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  20.07 
 
 		 911 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.54 
 
 		 1068 aa  66.6  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  21.85 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  22.33 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  26.16 
 
 		 599 aa  62  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  24.51 
 
 		 540 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  26.17 
 
 		 194 aa  57.4  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  28.37 
 
 		 964 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  24.38 
 
 		 852 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  36.84 
 
 		 393 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.92 
 
 		 979 aa  51.6  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.42 
 
 		 1003 aa  51.2  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  31.08 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1030 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  26.42 
 
 		 920 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  26.42 
 
 		 920 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  39.06 
 
 		 411 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 450 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  40.43 
 
 		 50 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.85 
 
 		 947 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  33.82 
 
 		 495 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  30.1 
 
 		 430 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  39.62 
 
 		 441 aa  45.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  21.13 
 
 		 947 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  47.5 
 
 		 433 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  36.51 
 
 		 433 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  36.21 
 
 		 418 aa  45.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  33.33 
 
 		 366 aa  45.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  21.92 
 
 		 992 aa  44.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  34.78 
 
 		 512 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  34.48 
 
 		 461 aa  44.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  35.48 
 
 		 410 aa  44.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>