98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3939 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 633 aa  1318    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  28.84 
 
 		 369 aa  121  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  31.15 
 
 		 345 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  31.4 
 
 		 201 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  29.67 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.58 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  26.77 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  26.12 
 
 		 407 aa  67  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  40.48 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  24.26 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  24.24 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  44.62 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  24.22 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  25.29 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  36.08 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  46.3 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  25.4 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.67 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.35 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.2 
 
 		 877 aa  57.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  41.51 
 
 		 380 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 		 947 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.02 
 
 		 370 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.58 
 
 		 467 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 		 296 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  31.34 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  31.73 
 
 		 217 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  26.32 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.63 
 
 		 464 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  26.2 
 
 		 202 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1953  putative DNA modification methylase  28.91 
 
 		 163 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  23.86 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  23.19 
 
 		 472 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  25.19 
 
 		 438 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.51 
 
 		 739 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  34.12 
 
 		 313 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 		 333 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  34.15 
 
 		 418 aa  51.2  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.8 
 
 		 849 aa  50.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 334 aa  50.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  30.53 
 
 		 463 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  42.42 
 
 		 146 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.91 
 
 		 395 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  40.26 
 
 		 512 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  24.53 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  25.58 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.23 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  23.87 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  35.37 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.21 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.56 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  24.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  41.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.94 
 
 		 253 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  19.93 
 
 		 374 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  40.43 
 
 		 304 aa  47.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 308 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 308 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 		 359 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  22.86 
 
 		 199 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  38.3 
 
 		 311 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.03 
 
 		 360 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  26.36 
 
 		 269 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  23.31 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.72 
 
 		 429 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  35.29 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 302 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  31.76 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.25 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.109552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  32.18 
 
 		 378 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  31.82 
 
 		 378 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  23.72 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  24.52 
 
 		 222 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.48 
 
 		 273 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  36.36 
 
 		 259 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  37.04 
 
 		 596 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  37.33 
 
 		 329 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  32.35 
 
 		 501 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.56 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  54.05 
 
 		 792 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  19.7 
 
 		 198 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 416 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.37 
 
 		 269 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 		 249 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  52.63 
 
 		 937 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.22 
 
 		 368 aa  44.3  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  26.04 
 
 		 408 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.11 
 
 		 386 aa  43.9  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.3 
 
 		 225 aa  43.9  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.5 
 
 		 255 aa  43.9  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.71 
 
 		 271 aa  43.9  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35 
 
 		 271 aa  43.9  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>