36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1419 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  55.9 
 
 
203 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  55.1 
 
 
203 aa  225  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  54.17 
 
 
201 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  40.54 
 
 
209 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  38.62 
 
 
198 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  36.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  38.62 
 
 
198 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  34.97 
 
 
202 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  39.36 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  35.48 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  39.06 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  38.66 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  28.26 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  31.61 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  25.26 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  26.46 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  30.29 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  26.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  30.37 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  29.83 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  28.88 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  26.13 
 
 
269 aa  85.1  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  27.81 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 
633 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  27.6 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  27.17 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  28.16 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  27.05 
 
 
228 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  27.56 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  27.64 
 
 
140 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  32.88 
 
 
85 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>