36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2489 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  37.04 
 
 
209 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  32 
 
 
202 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  31.75 
 
 
198 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  34.13 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  28.36 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  30.27 
 
 
201 aa  92  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  29.03 
 
 
205 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  29.79 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  29.47 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  27.37 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  27.81 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  26.5 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  32.02 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  26 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  25.93 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  28.97 
 
 
289 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  30.46 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  29.02 
 
 
225 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  26.26 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  27.69 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  27.69 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  26.16 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  26.02 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.28 
 
 
136 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  26.72 
 
 
150 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.28 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  30.66 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  22.14 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  29.45 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.22 
 
 
633 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>