38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0783 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  61.39 
 
 
269 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  60.39 
 
 
217 aa  248  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  61.65 
 
 
289 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  57.92 
 
 
237 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  61.7 
 
 
195 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  40.74 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  43.62 
 
 
198 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  42.54 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  34.17 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  33 
 
 
203 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  38.8 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  31.61 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  34.44 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  33.53 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  36.92 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  34.97 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  25.62 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  30.27 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  25.15 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  23.65 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  28.08 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  22.99 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  25.17 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  29.02 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  35.38 
 
 
197 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  25.62 
 
 
266 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.84 
 
 
633 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  33.66 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  29.2 
 
 
132 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  29.91 
 
 
136 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  22.41 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  24.81 
 
 
146 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  29.06 
 
 
136 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>