43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1329 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  90.4 
 
 		 198 aa  353  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  67.54 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  67.54 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  65.97 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  65.45 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  49.22 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  39.78 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  38.62 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  38.98 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  36.65 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  37.79 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  46.04 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  30.57 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  28.86 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  29.8 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  26.84 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  36.84 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  34.97 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  33.7 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  26 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  32 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  23.44 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  33.71 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  33.87 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  29.95 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  21.76 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  18.37 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  30.14 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  24.54 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  29.57 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  23.75 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  31.65 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0339  hypothetical protein  29.66 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.109845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  38.03 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  35.56 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19.78 
 
 		 633 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0066  hypothetical protein  27.13 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  30.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4655  hypothetical protein  32.47 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0293  hypothetical protein  27.78 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>