34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1624 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  90.15 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  55.1 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  45.69 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  41.24 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  39.31 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  36.56 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  38.98 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  36.02 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  36.52 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  40.12 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  39.25 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  39.25 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  40.8 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  34.76 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  34.17 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  32.11 
 
 		 289 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  30.26 
 
 		 269 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  29.79 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  30.46 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  31.41 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  32.84 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  26.49 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  23.83 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  29.03 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  21.58 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  19.9 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  29.03 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.27 
 
 		 633 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>