24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0646 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  73.08 
 
 
140 aa  207  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  46.03 
 
 
146 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  47.58 
 
 
133 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  40.87 
 
 
126 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  36.97 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  34.43 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  37.19 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  35.45 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  34.74 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  32.73 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  32.73 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  36.54 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  28.12 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  27.64 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  30.83 
 
 
206 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  27.59 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  31.97 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  29.2 
 
 
225 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  27.2 
 
 
237 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>