39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7701 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  61.17 
 
 		 217 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  61.7 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  61.17 
 
 		 289 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  60.1 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  58.82 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  38.25 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  44.03 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  37.1 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  35.68 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  29.83 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  31.32 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  29.35 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  32.84 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  25.26 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  29.32 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  32.26 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  33.87 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  27.08 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  22.34 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  33.9 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  28.65 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  34.48 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  33.91 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  33.91 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  24.8 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  20.86 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  45.83 
 
 		 85 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.53 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  29.47 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  29.7 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  36.73 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  23.53 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  33.75 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  23.53 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>