42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3049 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  52.48 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  47.59 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  41.58 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  40.54 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  41.4 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  39.24 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  37.04 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  39.78 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  39.31 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  36.98 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  30.57 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  40.74 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  37 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  35.78 
 
 		 269 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  35.11 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  36.18 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  25.89 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  39.89 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  36.27 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  38.99 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  39.89 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  39.89 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  40.44 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  37.1 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  25.25 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  30.67 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  22.95 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  25.33 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  28.91 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5492  hypothetical protein  40.66 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479834  normal  0.373592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  36.73 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  27.82 
 
 		 136 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  31.53 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  27.82 
 
 		 136 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  33.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  23.33 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  35.23 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>