37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2949 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  70.7 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  57.92 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  54.63 
 
 		 217 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  60.1 
 
 		 195 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  51.9 
 
 		 289 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  36.27 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  36.18 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  34.69 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  28.43 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  34.3 
 
 		 202 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  30.93 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  31.41 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  27.6 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  25.64 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  33.12 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  22.01 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  26.37 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  33.71 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  32.67 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  32.84 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  32.67 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  19.6 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  32.34 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  21.57 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  26.26 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  26.9 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  23.66 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.15 
 
 		 633 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  26.47 
 
 		 136 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  27.2 
 
 		 132 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  22.67 
 
 		 208 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>