32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4291 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  62.74 
 
 		 217 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  61.65 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  57.42 
 
 		 269 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  61.17 
 
 		 195 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  51.9 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  38 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  36.27 
 
 		 209 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  41.89 
 
 		 198 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  32.11 
 
 		 203 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  33.96 
 
 		 202 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  31.34 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  32.45 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  31.94 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  27.66 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  20.9 
 
 		 201 aa  67  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  24.82 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  26.52 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  28.97 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  21.21 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  31.43 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  31.43 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  30.86 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  24.5 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  30.29 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  28.36 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  24.06 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>