25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06812 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  79.23 
 
 		 136 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  78.46 
 
 		 136 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  36.3 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  33.85 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  36.45 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  35.45 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  31.31 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  29.82 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  29.23 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  30.34 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  23.44 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  28.91 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  33.66 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  26.87 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  26.72 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 289 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  24.51 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  33.8 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>