15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1900 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  43.38 
 
 
138 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  44.7 
 
 
138 aa  120  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  48.44 
 
 
133 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  45.04 
 
 
143 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  45.45 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  37.19 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  37.3 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  36.45 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  33.86 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  33.33 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  33.33 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  30.5 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  30.43 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  32.37 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>