16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1570 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.25 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  48.44 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  40.68 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  39.53 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  41.27 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  37.4 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  31.13 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  33.93 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  31.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  33.59 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>