19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4096 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  40.87 
 
 
132 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  35.48 
 
 
140 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  40.5 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  40.68 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  36.78 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  26.98 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  30.43 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  48.28 
 
 
222 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  31.15 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  23.44 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  30.19 
 
 
198 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  30.39 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  32.46 
 
 
198 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>