15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2409 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  41.5 
 
 
142 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  41.82 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  36.78 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  36.54 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  33.93 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  41.18 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  30.94 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  34.69 
 
 
172 aa  62  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  32.37 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  32.35 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  30.97 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  29.63 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.91 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>