15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0931 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  38.17 
 
 
146 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  41.27 
 
 
133 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  34.01 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  37.38 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  34.69 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  30.5 
 
 
137 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  28.12 
 
 
132 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  25.87 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  31.15 
 
 
126 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  29.82 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  32.5 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  25.44 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  25.44 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>