21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2451 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  100 
 
 
146 aa  290  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  46.03 
 
 
132 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  41.35 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  41.98 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  45.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  40.5 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  38.17 
 
 
172 aa  90.9  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  37.8 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  36.15 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  41.82 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  42.11 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.16 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.16 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  24.82 
 
 
222 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  28.23 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  24.46 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  28.36 
 
 
289 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  24.81 
 
 
225 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  29.23 
 
 
203 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>