33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1777 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  56.37 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  38.66 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  34.85 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  37.89 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  31.44 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  32.16 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  37.97 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  27.98 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  32.16 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  28.36 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  28.88 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  28.5 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  27.84 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  29.8 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  33.53 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  26.99 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  28.29 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  29.32 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  31.94 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  29.8 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  28.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  28.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  28.28 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  28.35 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  24.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  24.46 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  24.14 
 
 		 140 aa  42  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>