37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1224 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  92.39 
 
 		 197 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  90.86 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  66.49 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  67.54 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  48.69 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  38.02 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  39.25 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  37.89 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  39.89 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  41.85 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  37.57 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  36.81 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  34.42 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  31.29 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  23.5 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  28.28 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  38.58 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  31.43 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  31.79 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  27.69 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  30.14 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  24.52 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  23.81 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  19.27 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  24.71 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  24.05 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  30.07 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  30.71 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  37.97 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0339  hypothetical protein  28.97 
 
 		 183 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.109845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>