40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3058 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  95.43 
 
 		 198 aa  350  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  92.39 
 
 		 197 aa  335  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  92.39 
 
 		 197 aa  335  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  64.4 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  65.97 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  47.12 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  39.06 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  39.77 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  40.12 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  39.89 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  37.04 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  41.3 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  38.37 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  33.76 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  30.77 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  32.34 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  33.9 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  35.38 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  30.86 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  22 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  29.25 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  22.58 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  27.92 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  18.75 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  31.43 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  27.91 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  33.66 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4655  hypothetical protein  34.62 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  36.52 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0339  hypothetical protein  29.91 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.109845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  39.39 
 
 		 256 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  34.91 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>