25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0201 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  90.87 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  31.96 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  28.39 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  27.17 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  27.62 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  29.09 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  25.89 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  24.54 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  27.85 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  24.07 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  25.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  23.39 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  22.65 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  23.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  24.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  24.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  22.16 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  23.53 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  24.06 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  22.41 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  22.67 
 
 		 237 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  24.6 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>