34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1820 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  56.35 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  37.76 
 
 
201 aa  164  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  41.38 
 
 
212 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  39.7 
 
 
201 aa  141  6e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  34.85 
 
 
202 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  29.15 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  27.27 
 
 
202 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  25.76 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  25.25 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  26.46 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  24.24 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  23.83 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  27.78 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  25.26 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  23.44 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  24.23 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  21.58 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  22.01 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  21.63 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  23.5 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  23.5 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  22.99 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  22.27 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  22.34 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  21.21 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  22.5 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.4 
 
 
633 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  22 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  23.57 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1335  hypothetical protein  22.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0993069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0202  hypothetical protein  21.88 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  29.03 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>