32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1846 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  62.74 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  60.39 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  58.13 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  61.17 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  54.63 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  38.92 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  39.86 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  35.65 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  38.99 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  30.62 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  30.29 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  30.46 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  28.29 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  22.5 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  25.37 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  24 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  30.48 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  28.99 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  28.19 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  22.27 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  31.02 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  30.46 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  25.43 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  31.02 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  31.02 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.81 
 
 		 633 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  29.7 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>