20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1968 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  70.59 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  44.7 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  39.69 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  37.8 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  29.92 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  34.34 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  32.5 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  29.45 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  30.83 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  29.7 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  35.85 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  33.72 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>