20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4160 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  100 
 
 		 136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  99.26 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  78.46 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  30.65 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  32.73 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.16 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  34.34 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  31.13 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  30.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  32 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  30.48 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  29.47 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  25.53 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  27.82 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  30.28 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  29.06 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  25.49 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>