19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0716 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  70.59 
 
 
138 aa  201  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  43.38 
 
 
137 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  36.97 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  34.88 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  38.17 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  36.15 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  33.87 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  30.33 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  29.91 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.48 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.48 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  31.37 
 
 
199 aa  44.3  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  30.66 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  35.85 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>