33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0280 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  56.37 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  41.38 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  38.95 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  37.63 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  35.86 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  39.24 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  32.83 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  32.62 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  28.26 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  34.13 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  28.43 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  28.29 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  28.86 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  30.62 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  25.98 
 
 		 269 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  30.36 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  27.46 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  31.32 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  32.45 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  26.94 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  28.22 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  26.28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.14 
 
 		 633 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  41.6  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  28.85 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>