101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0737 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  822    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  48.34 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  48.66 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  47.48 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.92 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  49.35 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.47 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.82 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  20.5 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.12 
 
 		 633 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  26.55 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  34.95 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  35.8 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  36.73 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  20.61 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.93 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.06 
 
 		 947 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  23.95 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.21 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  31.43 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.34 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.9 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.1 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.99 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.16 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  34.57 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  41.33 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.47 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  22.83 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.16 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.95 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  21.45 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.84 
 
 		 284 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  25.21 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  32.71 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.08 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  46.15 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 		 849 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.59 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  31.18 
 
 		 535 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.79 
 
 		 530 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  36.99 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  36.84 
 
 		 852 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.23 
 
 		 739 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  34.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  26.51 
 
 		 878 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  24.81 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  35.62 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.77 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.6 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.07 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.56 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  45.45 
 
 		 596 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.7 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  29.69 
 
 		 472 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  24.51 
 
 		 916 aa  46.6  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.95 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.21 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  43.64 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.62 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 597 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.83 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 644 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  33.85 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.33 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  45.1 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.29 
 
 		 271 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.5 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2487  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  35.06 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  27.84 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.32 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  36.11 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  24.53 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  50 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 731 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.34 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.32 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  25.53 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 329 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.16 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.99 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 		 350 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.99 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 		 322 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  50 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  34.69 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  33.87 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.05 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>