101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3347 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  42.9 
 
 		 916 aa  759    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 878 aa  1823    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  37.62 
 
 		 894 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  37.91 
 
 		 892 aa  567  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  31.14 
 
 		 731 aa  360  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  30.94 
 
 		 746 aa  331  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  29.7 
 
 		 751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  31.03 
 
 		 737 aa  297  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  29.43 
 
 		 747 aa  291  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.75 
 
 		 651 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.71 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1071 aa  243  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1045 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1070 aa  229  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1118 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  25.71 
 
 		 936 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  25.51 
 
 		 934 aa  210  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  24.85 
 
 		 996 aa  207  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1003 aa  204  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.33 
 
 		 982 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1001 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  23 
 
 		 792 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  22.44 
 
 		 937 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  23.45 
 
 		 933 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.99 
 
 		 967 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  22.99 
 
 		 933 aa  145  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1106 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  23.82 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  22.2 
 
 		 920 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  22.12 
 
 		 961 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  21.55 
 
 		 960 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  22.16 
 
 		 848 aa  125  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  22.3 
 
 		 969 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  23.42 
 
 		 968 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1279 aa  121  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  21.07 
 
 		 968 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  23.35 
 
 		 951 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  21.2 
 
 		 906 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1001 aa  115  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  21.34 
 
 		 969 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  21.47 
 
 		 972 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  108  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  23.28 
 
 		 911 aa  104  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.28 
 
 		 911 aa  104  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  20.97 
 
 		 965 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  29.03 
 
 		 962 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  26.23 
 
 		 596 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  24.18 
 
 		 561 aa  87  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1012 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1008 aa  84.7  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  25.98 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  30.67 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  22.56 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  27.09 
 
 		 947 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  22.09 
 
 		 964 aa  71.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  20.06 
 
 		 599 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  22.15 
 
 		 852 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  20.93 
 
 		 992 aa  66.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.13 
 
 		 979 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.99 
 
 		 979 aa  59.7  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  26.32 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  30.94 
 
 		 194 aa  55.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  27.21 
 
 		 920 aa  55.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  27.21 
 
 		 920 aa  55.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  44.44 
 
 		 50 aa  54.7  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.55 
 
 		 739 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.61 
 
 		 1068 aa  51.6  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1030 aa  51.6  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  29.17 
 
 		 483 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  34.72 
 
 		 461 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  19.35 
 
 		 995 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  26.51 
 
 		 407 aa  49.3  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  31.96 
 
 		 450 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  35.53 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  34.85 
 
 		 441 aa  47.8  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 464 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  38.71 
 
 		 413 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  37.93 
 
 		 393 aa  47  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  21.73 
 
 		 501 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  30.68 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 		 315 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  34.69 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  39.02 
 
 		 475 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.81 
 
 		 292 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  34.21 
 
 		 433 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  47.5 
 
 		 433 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 		 396 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.75 
 
 		 239 aa  46.2  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  51.43 
 
 		 411 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.31 
 
 		 293 aa  45.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  47.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  36.67 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  47.37 
 
 		 284 aa  45.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  47.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  47.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  47.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  47.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  47.37 
 
 		 297 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.28 
 
 		 372 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  32.91 
 
 		 453 aa  44.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>