59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1848 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  47.72 
 
 		 1012 aa  875    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  46 
 
 		 920 aa  801    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  46.76 
 
 		 937 aa  859    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  48.93 
 
 		 951 aa  887    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  45.77 
 
 		 969 aa  810    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  42.71 
 
 		 961 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  46.25 
 
 		 906 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  48.99 
 
 		 968 aa  899    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  49.7 
 
 		 962 aa  900    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  71.35 
 
 		 933 aa  1410    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  76.16 
 
 		 848 aa  1298    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  70.32 
 
 		 933 aa  1397    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 968 aa  1985    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  48 
 
 		 972 aa  847    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  48.64 
 
 		 965 aa  867    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  48.16 
 
 		 969 aa  877    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  50.42 
 
 		 792 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  46.61 
 
 		 960 aa  826    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  48.39 
 
 		 561 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  46.68 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1001 aa  343  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  30.54 
 
 		 996 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  30.76 
 
 		 1003 aa  313  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  30.59 
 
 		 982 aa  308  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  27.6 
 
 		 967 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.84 
 
 		 934 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.21 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1106 aa  210  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  71.32 
 
 		 146 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  60.34 
 
 		 194 aa  198  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1279 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.31 
 
 		 911 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  23.31 
 
 		 911 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  20.36 
 
 		 916 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  23.29 
 
 		 878 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  23.84 
 
 		 947 aa  102  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  27.24 
 
 		 745 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1071 aa  92.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  42.45 
 
 		 121 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1070 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1045 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  22.91 
 
 		 731 aa  90.5  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1118 aa  90.1  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1008 aa  88.2  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  20.74 
 
 		 892 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1001 aa  83.2  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  23.32 
 
 		 747 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  21.47 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  29.57 
 
 		 964 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  22.95 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  22.05 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  21.6 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.76 
 
 		 703 aa  64.3  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  26.64 
 
 		 979 aa  58.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  26.79 
 
 		 995 aa  55.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.43 
 
 		 979 aa  52  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  52.17 
 
 		 1003 aa  50.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  51.35 
 
 		 453 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  40 
 
 		 433 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>