58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0198 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  49.85 
 
 		 1012 aa  892    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  47.18 
 
 		 920 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  50.05 
 
 		 937 aa  905    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  49.47 
 
 		 951 aa  880    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  47.48 
 
 		 969 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  45.01 
 
 		 961 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  50.98 
 
 		 906 aa  882    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  50.73 
 
 		 968 aa  934    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  53.26 
 
 		 962 aa  950    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  83.49 
 
 		 933 aa  1620    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  70.88 
 
 		 848 aa  1207    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1921    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  70.32 
 
 		 968 aa  1396    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  48.36 
 
 		 972 aa  853    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  49.84 
 
 		 965 aa  878    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  53.96 
 
 		 792 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  49.54 
 
 		 969 aa  885    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  46.45 
 
 		 960 aa  837    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  51.65 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  48.97 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  31.94 
 
 		 996 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1001 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1003 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  32.42 
 
 		 982 aa  314  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.61 
 
 		 934 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.43 
 
 		 936 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  84.5 
 
 		 146 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  75.71 
 
 		 194 aa  220  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1106 aa  201  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1279 aa  198  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  31.22 
 
 		 967 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  25.49 
 
 		 911 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.49 
 
 		 911 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  23.45 
 
 		 878 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  24.95 
 
 		 947 aa  138  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  24.38 
 
 		 916 aa  105  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1001 aa  100  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1071 aa  99.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1070 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1118 aa  97.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  30 
 
 		 1045 aa  92  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1008 aa  89.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  37.82 
 
 		 121 aa  87.8  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  21.86 
 
 		 751 aa  80.9  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  23.41 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  26.07 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  25.4 
 
 		 892 aa  79.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.4 
 
 		 747 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.21 
 
 		 979 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  21.43 
 
 		 894 aa  72.4  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.9 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.33 
 
 		 737 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.83 
 
 		 995 aa  61.6  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  23.1 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  54.35 
 
 		 964 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.93 
 
 		 979 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.8 
 
 		 1003 aa  55.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.96 
 
 		 651 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>