69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3100 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  81.61 
 
 		 1045 aa  1779    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  80.64 
 
 		 1071 aa  1826    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 1070 aa  2232    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  72.43 
 
 		 1118 aa  1689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  29.83 
 
 		 916 aa  265  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  29.38 
 
 		 878 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  28.57 
 
 		 892 aa  216  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  30.2 
 
 		 894 aa  204  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  27.94 
 
 		 746 aa  129  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  25.76 
 
 		 934 aa  128  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  29.95 
 
 		 731 aa  127  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  26.96 
 
 		 967 aa  121  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  31.36 
 
 		 936 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  32.92 
 
 		 982 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  31.01 
 
 		 960 aa  106  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  31.13 
 
 		 792 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  29.56 
 
 		 962 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  29.54 
 
 		 968 aa  103  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1279 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1106 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  26.81 
 
 		 965 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.44 
 
 		 703 aa  99  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  28.57 
 
 		 906 aa  98.6  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  29.8 
 
 		 972 aa  99  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.57 
 
 		 651 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  23.44 
 
 		 937 aa  97.8  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  30.13 
 
 		 933 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  30.17 
 
 		 969 aa  96.3  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  30.38 
 
 		 951 aa  96.3  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  27.45 
 
 		 961 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  25.49 
 
 		 747 aa  95.9  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  29.08 
 
 		 933 aa  95.9  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  25.63 
 
 		 561 aa  95.1  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  25.54 
 
 		 751 aa  95.1  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  28.5 
 
 		 996 aa  94.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1003 aa  92.8  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.78 
 
 		 737 aa  92  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  28.73 
 
 		 969 aa  91.3  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  27.93 
 
 		 968 aa  90.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  31.38 
 
 		 920 aa  89.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1012 aa  88.2  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1030 aa  87.8  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  26.25 
 
 		 848 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.24 
 
 		 911 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  27.24 
 
 		 911 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1001 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.1 
 
 		 1068 aa  79  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  26.91 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  36.89 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  24.94 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  28.81 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  26.9 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.95 
 
 		 947 aa  68.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  26.92 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  32.82 
 
 		 920 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  32.82 
 
 		 920 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  29.77 
 
 		 992 aa  67  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  28.46 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1001 aa  63.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  27.34 
 
 		 599 aa  60.1  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.55 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.36 
 
 		 979 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.58 
 
 		 596 aa  55.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  45.45 
 
 		 50 aa  54.3  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  21.67 
 
 		 964 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.52 
 
 		 995 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.05 
 
 		 1003 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.17 
 
 		 383 aa  45.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>