61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4275 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  48.38 
 
 
982 aa  881    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  44.74 
 
 
967 aa  798    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  44.59 
 
 
1003 aa  801    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  58.67 
 
 
996 aa  1169    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  100 
 
 
1001 aa  2068    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  32.68 
 
 
792 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  31.86 
 
 
937 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  31.02 
 
 
848 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  33.06 
 
 
951 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  34.01 
 
 
906 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  32.26 
 
 
920 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  32.37 
 
 
961 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  31.25 
 
 
933 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  31 
 
 
960 aa  363  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  31.39 
 
 
933 aa  353  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  29.42 
 
 
968 aa  343  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  29.52 
 
 
969 aa  333  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  30.29 
 
 
962 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  27.47 
 
 
934 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  32.93 
 
 
968 aa  330  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  27.69 
 
 
936 aa  325  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  30.98 
 
 
965 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  30.61 
 
 
1106 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  30.93 
 
 
1012 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  30.67 
 
 
969 aa  293  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  30.38 
 
 
972 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  32.57 
 
 
1279 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.39 
 
 
911 aa  227  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  28.39 
 
 
911 aa  227  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  31.83 
 
 
561 aa  182  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  25.69 
 
 
878 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.9 
 
 
916 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  24.37 
 
 
894 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.59 
 
 
1008 aa  168  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.95 
 
 
995 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  26.96 
 
 
745 aa  159  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  24.47 
 
 
892 aa  154  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  24.86 
 
 
964 aa  152  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.19 
 
 
979 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  27.15 
 
 
947 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  23.21 
 
 
731 aa  121  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  25.29 
 
 
1001 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  38.54 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.52 
 
 
737 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  23.94 
 
 
1045 aa  105  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.83 
 
 
1003 aa  104  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  23.72 
 
 
747 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.64 
 
 
1071 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  24.62 
 
 
1118 aa  97.8  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.95 
 
 
703 aa  95.1  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  22.11 
 
 
751 aa  92.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.5 
 
 
1070 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.32 
 
 
651 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  35.95 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.76 
 
 
979 aa  74.7  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  26.38 
 
 
746 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  20.42 
 
 
610 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
599 aa  51.2  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  24.82 
 
 
992 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  20.88 
 
 
852 aa  45.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  30.68 
 
 
374 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>