77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2196 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  60.88 
 
 
751 aa  892    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  58.51 
 
 
737 aa  876    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 
747 aa  1560    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  28.26 
 
 
916 aa  293  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  29.43 
 
 
878 aa  287  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  28.34 
 
 
746 aa  261  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.14 
 
 
894 aa  252  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  27.72 
 
 
892 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  28.59 
 
 
731 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  31.77 
 
 
703 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.59 
 
 
651 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.04 
 
 
982 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.18 
 
 
934 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  23.4 
 
 
936 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  22.45 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  22.55 
 
 
1003 aa  108  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  23.26 
 
 
792 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  25.81 
 
 
1045 aa  104  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  25.25 
 
 
1118 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  22.61 
 
 
996 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  23.72 
 
 
1001 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  29.84 
 
 
256 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.63 
 
 
1071 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  21.85 
 
 
937 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  24.9 
 
 
852 aa  97.4  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  25.49 
 
 
1070 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  22.7 
 
 
967 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  28.48 
 
 
1279 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  36.3 
 
 
1106 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  23.54 
 
 
961 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  21.24 
 
 
951 aa  83.2  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.21 
 
 
979 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  21.4 
 
 
933 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  23.32 
 
 
968 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  22.14 
 
 
1012 aa  75.1  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  21.2 
 
 
933 aa  74.7  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  21.57 
 
 
920 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  22.21 
 
 
848 aa  74.3  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  21.73 
 
 
969 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.61 
 
 
1003 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  19.12 
 
 
1030 aa  71.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  21.39 
 
 
969 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  25.77 
 
 
964 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  21.65 
 
 
906 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.75 
 
 
1068 aa  66.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  20.04 
 
 
992 aa  66.6  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  21.79 
 
 
960 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  53.06 
 
 
50 aa  63.9  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  20.4 
 
 
962 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  20.83 
 
 
972 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  30.18 
 
 
947 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.29 
 
 
979 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.52 
 
 
965 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  21.79 
 
 
561 aa  59.3  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.78 
 
 
1001 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  21.67 
 
 
968 aa  58.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  31.15 
 
 
540 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  29.14 
 
 
745 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  23.18 
 
 
596 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  24.53 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.19 
 
 
1008 aa  51.6  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  21.82 
 
 
947 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  22.28 
 
 
599 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  34.26 
 
 
393 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  42.11 
 
 
418 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  20.81 
 
 
911 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.81 
 
 
911 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  21.43 
 
 
920 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  21.43 
 
 
920 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  35.94 
 
 
483 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2036  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  34.48 
 
 
75 aa  45.8  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00217596  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  35.21 
 
 
535 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  42.11 
 
 
393 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  26.55 
 
 
413 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  37.23 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  52.63 
 
 
433 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  37.1 
 
 
441 aa  44.3  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>