91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1948 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 731 aa  1522    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  47.19 
 
 		 746 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  32.58 
 
 		 916 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  31.14 
 
 		 878 aa  347  6e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  30.97 
 
 		 894 aa  295  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  29.84 
 
 		 892 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.85 
 
 		 703 aa  232  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  28.59 
 
 		 747 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  26.97 
 
 		 751 aa  221  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.05 
 
 		 651 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.32 
 
 		 737 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1071 aa  147  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1003 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1118 aa  142  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1045 aa  140  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1070 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  24.55 
 
 		 982 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1001 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  22.57 
 
 		 936 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.35 
 
 		 967 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  20.74 
 
 		 934 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  36.48 
 
 		 996 aa  97.8  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  37.59 
 
 		 1279 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1106 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  22.91 
 
 		 968 aa  90.9  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.27 
 
 		 979 aa  90.5  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  22.79 
 
 		 968 aa  89  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  23 
 
 		 937 aa  88.2  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  32.11 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  30.05 
 
 		 745 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  32.47 
 
 		 599 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  23.48 
 
 		 960 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  23.41 
 
 		 933 aa  80.9  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  22.19 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  22.99 
 
 		 972 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  30.91 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  33.12 
 
 		 947 aa  74.7  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  30.07 
 
 		 911 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.07 
 
 		 911 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  21.72 
 
 		 969 aa  74.3  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  26.25 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  20.59 
 
 		 906 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1008 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  20 
 
 		 995 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1012 aa  67.8  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  29.19 
 
 		 969 aa  64.3  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1001 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  26.87 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  29.22 
 
 		 951 aa  62  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  22.62 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  30.14 
 
 		 852 aa  61.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.54 
 
 		 1068 aa  60.1  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  28.87 
 
 		 979 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.56 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  26.62 
 
 		 965 aa  58.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  30.43 
 
 		 1003 aa  57.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1030 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  28.37 
 
 		 920 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  28.37 
 
 		 920 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  30.23 
 
 		 962 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  27.27 
 
 		 964 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  27.35 
 
 		 501 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  23.78 
 
 		 792 aa  54.3  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  43.64 
 
 		 483 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  24.69 
 
 		 961 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  28.23 
 
 		 596 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  39.68 
 
 		 441 aa  50.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  30.12 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 947 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  38.6 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  27.42 
 
 		 430 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  46.81 
 
 		 393 aa  48.9  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  57.14 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  29.46 
 
 		 920 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.51 
 
 		 416 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.49 
 
 		 524 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  44.23 
 
 		 411 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 		 388 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.94 
 
 		 271 aa  46.6  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  51.52 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3032  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 		 352 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  46.15 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  39.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.55 
 
 		 372 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  40 
 
 		 433 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  34.58 
 
 		 410 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  44.64 
 
 		 414 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  56.76 
 
 		 535 aa  45.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  48.57 
 
 		 463 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  36 
 
 		 512 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>