61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0682 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  70.88 
 
 		 933 aa  1207    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  48.34 
 
 		 920 aa  747    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  51.18 
 
 		 937 aa  826    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  50.7 
 
 		 951 aa  814    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  49.15 
 
 		 969 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  44.69 
 
 		 961 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  50.89 
 
 		 906 aa  800    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  50.57 
 
 		 968 aa  816    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  50.34 
 
 		 962 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  75.18 
 
 		 933 aa  1276    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 848 aa  1743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  76.16 
 
 		 968 aa  1298    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  49.43 
 
 		 972 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  49.08 
 
 		 965 aa  783    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  50.86 
 
 		 1012 aa  843    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  48.12 
 
 		 960 aa  766    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  51.38 
 
 		 792 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  52.57 
 
 		 969 aa  874    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  54.11 
 
 		 561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1001 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  30.6 
 
 		 996 aa  342  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1003 aa  331  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  30.93 
 
 		 982 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  49.7 
 
 		 455 aa  310  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.33 
 
 		 967 aa  271  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.94 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.85 
 
 		 936 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1106 aa  201  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  60.34 
 
 		 194 aa  197  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1279 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  20.54 
 
 		 916 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  21.49 
 
 		 878 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1001 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.92 
 
 		 911 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  22.92 
 
 		 911 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  20.64 
 
 		 892 aa  107  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.49 
 
 		 947 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1008 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1071 aa  91.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1045 aa  88.6  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1118 aa  89  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  25.47 
 
 		 745 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1070 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  22.08 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.21 
 
 		 747 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  32.2 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  22.36 
 
 		 894 aa  72  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  21.55 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  28.57 
 
 		 731 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.19 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.95 
 
 		 979 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.63 
 
 		 703 aa  61.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.48 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.45 
 
 		 995 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.17 
 
 		 1003 aa  55.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.37 
 
 		 979 aa  54.7  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  37.1 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  40.74 
 
 		 433 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  51.35 
 
 		 453 aa  45.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  40 
 
 		 393 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.78 
 
 		 947 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>