59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0638 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  47.3 
 
 
1012 aa  797    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  51.95 
 
 
920 aa  897    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  51.52 
 
 
937 aa  942    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  47.26 
 
 
951 aa  810    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  46.16 
 
 
969 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  49.38 
 
 
961 aa  856    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  100 
 
 
906 aa  1889    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  45.5 
 
 
968 aa  791    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  51.08 
 
 
962 aa  876    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  51.19 
 
 
933 aa  906    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  50.89 
 
 
848 aa  818    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  50.98 
 
 
933 aa  902    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  46.25 
 
 
968 aa  817    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  46.91 
 
 
972 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  47.66 
 
 
965 aa  783    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  50.9 
 
 
960 aa  856    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  57.81 
 
 
792 aa  917    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  47.13 
 
 
969 aa  787    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  46.64 
 
 
561 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  34.01 
 
 
1001 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  32.42 
 
 
996 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  33.96 
 
 
1003 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  46.45 
 
 
455 aa  354  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  31.13 
 
 
982 aa  346  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  27.97 
 
 
967 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  28.46 
 
 
934 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  28.57 
 
 
936 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  78.57 
 
 
194 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  27.1 
 
 
1106 aa  213  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  31.25 
 
 
1279 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.13 
 
 
911 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  26.13 
 
 
911 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  26.11 
 
 
1008 aa  163  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  26.28 
 
 
947 aa  161  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.2 
 
 
916 aa  146  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  22.62 
 
 
892 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  21.2 
 
 
878 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  28.11 
 
 
1001 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  23.19 
 
 
1118 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.57 
 
 
1070 aa  99  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  27 
 
 
1071 aa  94  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  22.45 
 
 
1045 aa  89.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.99 
 
 
703 aa  83.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  24.92 
 
 
745 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  24.05 
 
 
894 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  40.74 
 
 
121 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  22.79 
 
 
746 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  20.59 
 
 
731 aa  73.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.95 
 
 
747 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  25.71 
 
 
964 aa  65.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  33.61 
 
 
146 aa  61.6  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.8 
 
 
979 aa  61.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.74 
 
 
737 aa  60.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  27.74 
 
 
751 aa  58.9  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.32 
 
 
995 aa  58.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.93 
 
 
979 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.21 
 
 
651 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  26.47 
 
 
1003 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  26.96 
 
 
332 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>