72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3097 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  60.19 
 
 
751 aa  927    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  100 
 
 
737 aa  1529    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  58.51 
 
 
747 aa  876    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  28.38 
 
 
916 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  31.03 
 
 
878 aa  294  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  30.51 
 
 
746 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.82 
 
 
894 aa  264  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  28.05 
 
 
892 aa  247  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.35 
 
 
651 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  27.32 
 
 
731 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.9 
 
 
703 aa  210  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  24.79 
 
 
982 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  23.85 
 
 
610 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  22.46 
 
 
1003 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  22.86 
 
 
936 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  23.48 
 
 
934 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  23.56 
 
 
1001 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.18 
 
 
967 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  23.42 
 
 
996 aa  107  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  22.19 
 
 
937 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  25.25 
 
 
1045 aa  105  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.95 
 
 
1071 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  27.37 
 
 
1106 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  22.33 
 
 
852 aa  97.4  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.56 
 
 
792 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  24.19 
 
 
1118 aa  95.9  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  23.78 
 
 
1070 aa  92  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  26.24 
 
 
256 aa  87.8  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  27.52 
 
 
1279 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  21.38 
 
 
951 aa  77.8  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  21.47 
 
 
968 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  61.22 
 
 
50 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  24.26 
 
 
947 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  24.79 
 
 
964 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  22.19 
 
 
848 aa  68.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.77 
 
 
965 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  23.3 
 
 
968 aa  67.4  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  28.33 
 
 
933 aa  64.3  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  27.22 
 
 
933 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  29.61 
 
 
969 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  31.15 
 
 
540 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  20.74 
 
 
992 aa  60.8  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  27.27 
 
 
962 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  27.74 
 
 
906 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  28.57 
 
 
1012 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2036  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  38.33 
 
 
75 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  26.67 
 
 
561 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.73 
 
 
1068 aa  58.9  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  23.12 
 
 
1030 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  21.49 
 
 
911 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  21.49 
 
 
911 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.8 
 
 
1001 aa  57.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  27.5 
 
 
961 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  25.58 
 
 
920 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.93 
 
 
979 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  26.17 
 
 
960 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  26.06 
 
 
969 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  20.36 
 
 
920 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  20.36 
 
 
920 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  26.15 
 
 
599 aa  53.9  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  25 
 
 
972 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  25 
 
 
596 aa  51.2  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.37 
 
 
1003 aa  50.8  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  28.68 
 
 
393 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  25.45 
 
 
947 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  32.93 
 
 
535 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  36.36 
 
 
430 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  27.65 
 
 
745 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
455 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  20.52 
 
 
1008 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  46 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.74 
 
 
995 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>