20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0685 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  90.7 
 
 
933 aa  244  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  84.5 
 
 
933 aa  228  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  71.32 
 
 
968 aa  200  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  45.3 
 
 
965 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  40.18 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  39.5 
 
 
961 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  40.48 
 
 
972 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  43.97 
 
 
455 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  37.98 
 
 
960 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  41.74 
 
 
962 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  37.5 
 
 
937 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  33.07 
 
 
969 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  36.89 
 
 
968 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  37.07 
 
 
951 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  35.71 
 
 
1012 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  38.94 
 
 
969 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  35.4 
 
 
561 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  33.61 
 
 
906 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  30.16 
 
 
920 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>