69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2132 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  75.09 
 
 		 1045 aa  1696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  72.43 
 
 		 1070 aa  1689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  74.6 
 
 		 1071 aa  1736    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 1118 aa  2340    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  33.82 
 
 		 916 aa  262  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  33.81 
 
 		 894 aa  222  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  30.46 
 
 		 878 aa  215  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  29.08 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  29.67 
 
 		 731 aa  142  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  30.75 
 
 		 746 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  30.86 
 
 		 934 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  30.86 
 
 		 936 aa  119  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  32.74 
 
 		 982 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.37 
 
 		 703 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  26.49 
 
 		 967 aa  111  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  28.76 
 
 		 792 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1279 aa  107  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  24.9 
 
 		 751 aa  106  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  31.85 
 
 		 960 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1106 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  25.25 
 
 		 747 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  25.32 
 
 		 972 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.82 
 
 		 651 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  23.19 
 
 		 906 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  31.02 
 
 		 969 aa  99  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  31.66 
 
 		 962 aa  98.6  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  29.1 
 
 		 951 aa  98.2  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  28.63 
 
 		 968 aa  97.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  30.08 
 
 		 933 aa  97.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  30.49 
 
 		 965 aa  96.3  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1003 aa  96.3  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.19 
 
 		 737 aa  95.9  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  27.98 
 
 		 561 aa  95.1  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  26.88 
 
 		 937 aa  92.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1001 aa  91.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  27.64 
 
 		 933 aa  91.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  28.57 
 
 		 996 aa  90.9  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.54 
 
 		 1068 aa  90.9  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  27.94 
 
 		 968 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  26.1 
 
 		 961 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  28.57 
 
 		 969 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1030 aa  88.6  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1012 aa  88.6  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  26.23 
 
 		 848 aa  88.6  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  29.71 
 
 		 920 aa  86.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1008 aa  82.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  31.41 
 
 		 852 aa  79  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.94 
 
 		 911 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  32.62 
 
 		 992 aa  78.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  25.94 
 
 		 911 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  24.71 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  25.18 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  28.29 
 
 		 745 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1001 aa  69.3  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  32.54 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  34.11 
 
 		 920 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  28.79 
 
 		 947 aa  67  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  35.25 
 
 		 256 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  34.11 
 
 		 920 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 		 739 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.03 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  22.88 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  28.28 
 
 		 599 aa  62  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  29.66 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.07 
 
 		 995 aa  55.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  45.45 
 
 		 50 aa  54.3  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.32 
 
 		 1003 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24 
 
 		 383 aa  48.5  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  24.86 
 
 		 964 aa  48.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>