68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2009 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  2058    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  58.63 
 
 		 1001 aa  1200    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  47.6 
 
 		 967 aa  867    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  50.6 
 
 		 982 aa  920    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1003 aa  776    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  33.93 
 
 		 937 aa  399  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  31.41 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  32.86 
 
 		 920 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  32.19 
 
 		 906 aa  364  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  31.26 
 
 		 960 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  31.94 
 
 		 933 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  30.89 
 
 		 933 aa  353  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  32.81 
 
 		 951 aa  350  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  30.51 
 
 		 848 aa  348  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  30.33 
 
 		 968 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  31.49 
 
 		 961 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  31.64 
 
 		 968 aa  330  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  28.97 
 
 		 934 aa  320  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  29.96 
 
 		 936 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  29.62 
 
 		 962 aa  312  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  31.23 
 
 		 965 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  29.23 
 
 		 969 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1106 aa  301  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1279 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  29.89 
 
 		 969 aa  275  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  29.71 
 
 		 972 aa  270  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1012 aa  269  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  25.09 
 
 		 878 aa  205  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.09 
 
 		 911 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  26.09 
 
 		 911 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  28.89 
 
 		 561 aa  168  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  24.83 
 
 		 964 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1008 aa  161  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.48 
 
 		 916 aa  161  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.44 
 
 		 995 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.44 
 
 		 979 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  23.31 
 
 		 894 aa  148  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  26.91 
 
 		 947 aa  144  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  25.36 
 
 		 745 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  23.09 
 
 		 892 aa  131  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  39.89 
 
 		 194 aa  124  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.62 
 
 		 1003 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.5 
 
 		 703 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.42 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  24.14 
 
 		 746 aa  110  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  28.86 
 
 		 455 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.7 
 
 		 747 aa  105  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  21.88 
 
 		 751 aa  104  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1045 aa  99.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  36.48 
 
 		 731 aa  97.8  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1001 aa  97.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.37 
 
 		 979 aa  96.3  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1071 aa  95.1  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1070 aa  94.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1118 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  21.88 
 
 		 651 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  30.05 
 
 		 599 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  26.9 
 
 		 992 aa  58.9  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  24.52 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.12 
 
 		 596 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 		 1068 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.95 
 
 		 739 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  28.12 
 
 		 920 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 920 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  23.08 
 
 		 852 aa  48.5  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1030 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  22.08 
 
 		 501 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  41.3 
 
 		 467 aa  45.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>