62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0506 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 1003 aa  2041    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  43.66 
 
 		 982 aa  705    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  42.97 
 
 		 967 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  44.73 
 
 		 996 aa  751    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  44.84 
 
 		 1001 aa  796    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  33.57 
 
 		 792 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  32.22 
 
 		 960 aa  364  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  33.46 
 
 		 920 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  32.81 
 
 		 937 aa  354  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  32.47 
 
 		 961 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  33.96 
 
 		 906 aa  343  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  29.63 
 
 		 848 aa  327  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  31.84 
 
 		 968 aa  325  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  31.54 
 
 		 933 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  32.39 
 
 		 951 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  30.57 
 
 		 933 aa  313  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  29.88 
 
 		 968 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  30.59 
 
 		 962 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  30.75 
 
 		 969 aa  292  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1012 aa  283  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  28.27 
 
 		 934 aa  281  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  31 
 
 		 972 aa  274  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  31.23 
 
 		 965 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  28.42 
 
 		 936 aa  267  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  29.32 
 
 		 969 aa  255  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1106 aa  238  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1279 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1008 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  27.63 
 
 		 911 aa  201  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.63 
 
 		 911 aa  201  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  25 
 
 		 878 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.48 
 
 		 916 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  23.59 
 
 		 894 aa  170  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  28.08 
 
 		 947 aa  160  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  28.51 
 
 		 561 aa  148  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  24.53 
 
 		 731 aa  145  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  23.2 
 
 		 892 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  45.86 
 
 		 194 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1001 aa  135  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  23.71 
 
 		 746 aa  127  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  28.42 
 
 		 745 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.46 
 
 		 737 aa  121  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.9 
 
 		 979 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.71 
 
 		 979 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.02 
 
 		 703 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.19 
 
 		 651 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  25.36 
 
 		 964 aa  109  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.55 
 
 		 747 aa  108  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.03 
 
 		 995 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.04 
 
 		 1003 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1118 aa  96.3  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  20.68 
 
 		 751 aa  94  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1070 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1045 aa  92.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  38.64 
 
 		 455 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1071 aa  88.6  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  24.13 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  23.08 
 
 		 540 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  23.15 
 
 		 599 aa  53.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  21.36 
 
 		 920 aa  45.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  21.36 
 
 		 920 aa  45.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  25.13 
 
 		 992 aa  44.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>