68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3117 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  94.66 
 
 
934 aa  1830    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  100 
 
 
936 aa  1947    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  27.69 
 
 
1001 aa  314  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  29.9 
 
 
996 aa  303  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  28.85 
 
 
982 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  26.63 
 
 
937 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.75 
 
 
967 aa  274  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  28.42 
 
 
1003 aa  268  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  26.43 
 
 
920 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  28.57 
 
 
906 aa  255  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  27 
 
 
792 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  25.68 
 
 
960 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  25.1 
 
 
1106 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  25.85 
 
 
951 aa  231  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  24.43 
 
 
933 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  25.73 
 
 
961 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  24.52 
 
 
933 aa  226  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  25.73 
 
 
972 aa  225  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  24.28 
 
 
962 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  25.14 
 
 
969 aa  222  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  27.29 
 
 
1279 aa  220  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  24.15 
 
 
968 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  26.1 
 
 
968 aa  216  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  24.85 
 
 
848 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  24.89 
 
 
965 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  24.5 
 
 
1012 aa  205  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  25.71 
 
 
878 aa  205  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  24.19 
 
 
969 aa  199  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.97 
 
 
911 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  24.97 
 
 
911 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.8 
 
 
1008 aa  195  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  24.57 
 
 
1001 aa  193  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.62 
 
 
916 aa  191  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  24.47 
 
 
892 aa  179  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.66 
 
 
947 aa  168  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  26.82 
 
 
964 aa  161  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.26 
 
 
979 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.96 
 
 
995 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  25.48 
 
 
979 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  26.49 
 
 
561 aa  143  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  21.78 
 
 
894 aa  142  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  22.14 
 
 
746 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.99 
 
 
1003 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.7 
 
 
651 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  29.1 
 
 
1071 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  31.36 
 
 
1070 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  30.86 
 
 
1118 aa  119  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  28.45 
 
 
455 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  23.4 
 
 
747 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  23.01 
 
 
751 aa  117  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  29.65 
 
 
1045 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  22.96 
 
 
745 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  22.57 
 
 
731 aa  112  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.86 
 
 
737 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.41 
 
 
703 aa  99  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  26.39 
 
 
596 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  31.21 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  73.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  20.07 
 
 
852 aa  68.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  25.88 
 
 
1030 aa  64.7  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  25.22 
 
 
992 aa  62  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  20.63 
 
 
599 aa  59.7  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.29 
 
 
1068 aa  59.7  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  29.45 
 
 
920 aa  58.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  29.45 
 
 
920 aa  58.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.89 
 
 
739 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  28.03 
 
 
540 aa  54.7  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  20.07 
 
 
947 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>