58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4967 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  100 
 
 
745 aa  1447    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  32.57 
 
 
1106 aa  190  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  29.01 
 
 
982 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  27.87 
 
 
1001 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  29.29 
 
 
1003 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  37.37 
 
 
1279 aa  184  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  28 
 
 
920 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  26.48 
 
 
968 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  23.01 
 
 
934 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  26.22 
 
 
792 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  26.35 
 
 
996 aa  161  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  26.51 
 
 
933 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  25.37 
 
 
848 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  26.6 
 
 
933 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.09 
 
 
967 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  22.95 
 
 
936 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  25.51 
 
 
906 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  26.59 
 
 
968 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  26.43 
 
 
937 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  26.11 
 
 
951 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  23.51 
 
 
961 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  23.54 
 
 
960 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  25.72 
 
 
965 aa  136  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  24.34 
 
 
962 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  22.95 
 
 
969 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  24.12 
 
 
894 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  27.3 
 
 
972 aa  111  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  21.8 
 
 
878 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  25 
 
 
911 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25 
 
 
911 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  27 
 
 
1012 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.48 
 
 
651 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  24.93 
 
 
969 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  24.73 
 
 
561 aa  91.3  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  22.46 
 
 
746 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.81 
 
 
703 aa  89.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  25.07 
 
 
1045 aa  86.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  31.03 
 
 
731 aa  85.9  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  25.09 
 
 
610 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  22.22 
 
 
1008 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  26.24 
 
 
947 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  27.45 
 
 
892 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  23.74 
 
 
747 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  28.29 
 
 
1118 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  26.42 
 
 
1071 aa  75.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  26.92 
 
 
1070 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.16 
 
 
916 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  35.82 
 
 
194 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.7 
 
 
737 aa  70.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.53 
 
 
1001 aa  68.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  28.93 
 
 
964 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  24 
 
 
599 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.93 
 
 
979 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  28.8 
 
 
751 aa  50.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  53.66 
 
 
1003 aa  47.4  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  31.36 
 
 
995 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  24.41 
 
 
992 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>